In Star Trek Captain's Chair nemen jij en jouw tegenstander de rol aan van één van de Star Trek Captains Jean-Luc Picard, Bejamin Sisko, Michael Burnham, Koloth, the Dahar Master, Sela of Thy'lek Shran en nemen het tegen elkaar op. Leid schepen en bemanning terwijl je grondstoffen en allianties managet.

Elke kapitein heeft in Star Trek Captain's Chair een eigen, unieke set kaarten die passen bij de persoonlijkheid van die kapitein. Elke set geeft je andere strategische mogelijkheden op basis van de beschikbare kaarten en de strategie van jouw tegenstander.

Zoals gebruikelijk in Star Trek is antagonisme niet altijd de weg naar de overwinning. Je moet je ook bezighouden met diplomatie, onderzoek en wetenschap, waarbij de verschillende kapiteins elk hun eigen sterke en zwakke punten hebben.

Het is aan jou, Captain!